МАОУ «Флагман» г. Перми не имеет структурных подразделений и филиалов.
Руководителей и зам. руководителей структурных подразделений и филиалов нет.
Управление школой осуществляется: директором школы и коллегиальными органами управления:
1) Общим собранием трудового коллектива
Положение об общем собрании трудового коллектива
2) Управляющим советом
Положение об Управляющем совете
3) Наблюдательным советом